Trong đó, điểm nhấn kiến trúc nổi bật giếng trời lấy sáng (Toplight) thiết kế với hình ảnh hoa sen cách điệu, các vật liệu này được lựa chọn và nhập khẩu trực tiếp từ Nhật Bản, có khả năng chống chịu thời tiết tốt cũng như cách âm, cách nhiệt vượt trội. Giếng trời có chức năng chính cung cấp ánh sáng và thông gió cho khu vực phía dưới nhà ga ngầm. Với thiết kế tường kính bao bọc chung quanh tạo nên không gian mở cho công trình, giúp cho du khách có thể nhìn ngắm các hoạt động nhà ga bên dưới.

Theo Ban Quản lý đường sắt đô thị TPHCM, hiện tại phần kiến trúc của nhà ga trung tâm Bến Thành đã hoàn thiện 99%, đang trong quá trình sửa chữa lỗi nhỏ để bàn giao cho các gói thầu liên quan trong quá trình nghiệm thu.